Déclin des études microbiennes chez les patients atteints d’infections pulmonaires

Ce numéro de Clinical Infectious Diseases contient une revue de Musher et al qui traite de la question de l’utilisation de la coloration et des cultures de Gram athérome. des échantillons d’expectoration chez les patients atteints de pneumonie pneumococcique bactériémique Leur examen rétrospectif a montré que les patients qui pouvaient fournir un échantillon d’expectoration expectoré avaient des rendements de pneumocoque de% et de% pour la coloration de Gram et la culture, respectivement; pour les patients traités avec des antibiotiques pour & lt; h, les rendements étaient de% et de%, respectivement. Est-ce une expérience qui était idiosyncratique au Centre médical des Anciens Combattants de Houston? Est-ce que Musher et ses collègues ont personnellement examiné les diapositives pour faire l’interprétation des experts? les spécimens ont été transportés rapidement de la salle au laboratoire, financés par une subvention de recherche, afin d’assurer la cohérence et la reproductibilité aux fins de la présente revue et du rapport. La réponse à toutes les questions est non; il s’agissait simplement d’une revue rétrospective de la performance du laboratoire hospitalier et de l’expertise des techniciens en microbiologie. Le processus de routine comprenait une analyse cytologique et une attention dans l’interprétation du rendement diminué après traitement antibiotique, des problèmes de contrôle de qualité les plus importants. Ainsi, dans les circonstances du Houston Veterans Affairs Medical Center, qui ne sont probablement pas significativement différentes de celles des autres laboratoires hospitaliers, un rendement relativement élevé peut être obtenu avec la coloration de Gram et la culture d’échantillons d’expectorations expectorés, à condition Les limitations qui pourraient être reconnues sont l’impossibilité d’étendre ces conclusions à tout agent pathogène bactérien autre que S pneumoniae ou aux infections pneumococciques non associées à la bactériémie. Au cours des dernières années, un test urinaire a été effectué. dosage d’antigène Binax maintenant pour le La détection de la pneumonie à S pneumoniae a été introduite L’une des questions évidentes auxquelles sont confrontés les cliniciens et les microbiologistes est celle des mérites relatifs de ce nouveau test comparé à ceux des études traditionnelles de coloration et de culture de Gram. Dans un rapport antérieur analogue à l’article par Musher et coll. , Smith et al ont comparé le rendement des résultats positifs obtenus avec le test antigénique urinaire pneumococcique chez les adultes atteints de pneumonie pneumococcique bactériémique au rendement chez les patients témoins atteints de bactériémie impliquant d’autres agents pathogènes. % D’autres ont rapporté des résultats similaires, montrant que le test d’antigène urinaire était aussi bon ou plutôt meilleur que les études microbiologiques conventionnelles Il y a au moins des raisons pour lesquelles ce test est maintenant attrayant: la sensibilité et la spécificité semblent être aussi bon que ceux pour la coloration conventionnelle de Gram et la culture pour les adultes, mais pas pour ch les résultats des tests sont valables après l’administration des antibiotiques, et la pression actuelle pour délivrer des antibiotiques after h après l’enregistrement aux urgences pour se conformer aux normes de performance Medicare attendues peut rendre cela plus réaliste si l’on considère la logistique requise pour les études microbiologiques conventionnelles. départements d’urgence Deux raisons pour lesquelles les études microbiologiques conventionnelles peuvent être préférées sont le coût des réactifs, qui est d’environ $ par échantillon pour le test de l’antigène urinaire; et l’absence d’un microbe pour les tests de sensibilité, qui, pour de nombreuses personnes, peut être le problème le plus important, tant pour le traitement individuel que pour la détermination de l’information populationnelle. Dans de nombreux cas, les recommander les deux Certains considèrent le déclin des études microbiologiques résumées ci-dessus comme un signe des temps, mais d’autres le considèrent comme dérangeant dans le contexte du traitement individuel des patients et de la détermination de l’information basée sur la population. lorsque la priorité des examens microbiologiques pour les infections pulmonaires augmente considérablement, ce qui n’a pu être prédit il y a plusieurs années. Ceci est rapporté par des événements récents qui soulignent l’importance potentielle de bonnes études microbiologiques dans le contexte de plusieurs infections qui méritent une attention particulière. importance en épidémiologie et en gestion Les exemples sont des Le syndrome respiratoire, la grippe HN, l’anthrax par inhalation, la pneumonie nécrosante due à S. aureus résistant à la méthicilline acquise et l’infection à Legionella nécessitent une approche non conventionnelle de la thérapie et / ou une enquête épidémiologique pouvant avoir un impact régional ou national rapport de Musher et al devrait nous aider à nous remettre sur la bonne voie

Reconnaissance

Conflit d’intérêts JGB est consultant en matière de VIH pour Bristol-Myers Squibb