Essai de panneau de PCR multiplex pour les pathogènes viraux et gastro-intestinaux

Les tests de panel PCR multiplex pour les pathogènes viraux et gastro-intestinaux ainsi que l’identification rapide des infections sanguines peuvent détecter plus de pathogènes plus rapidement que les méthodes de microbiologie traditionnelles. Cependant, les panneaux, offerts par des fabricants tels que BioFire, Luminex, et Nanosphere, viennent à un prix élevé. Un récent article de CAP TODAY a mis en lumière l’opinion des experts de l’industrie sur l’utilisation clinique de ces panneaux en raison de leur coût élevé.

Robin Patel, M.D.

Robin Patel, MD, président de la division de microbiologie clinique et consultant dans les laboratoires de microbiologie clinique et de maladies infectieuses à la Mayo Clinic, a parlé de la disponibilité des panels GI multiplexes, mais partage l’inquiétude de nombreux cliniciens gastro-intestinal. à propos de leur coût et du potentiel de conséquences imprévues.

À Mayo, le Dr Patel et ses collègues ont évalué les panneaux Luminex et BioFire GI. « Nous avons constaté qu’ils étaient tous les deux très bons », a déclaré le Dr Patel. Mayo a opté pour le panel GI de BioFire (qui est entré en service le 12 octobre 2015), en partie parce que le laboratoire utilise déjà la plate-forme FilmArray pour l’identification de la culture sanguine.

En dépit d’excellentes performances analytiques du panel GI, Dr. Patel a déclaré que son laboratoire encourage l’utilisation de première intention du panel chez certains patients seulement et met en garde contre l’incertitude diagnostique qu’ils peuvent créer. « Ces tests détectent des cibles que nous n’avons pas pu détecter par le passé », a déclaré le Dr Patel. « Cela semble être une chose incontestablement bonne, mais ce n’est pas forcément toujours le cas – quand vous détectez quelque chose que vous ne pouviez pas détecter auparavant, il peut être difficile de savoir quoi faire de ce résultat. »

Par exemple, le panneau FilmArray GI peut détecter 22 pathogènes dans les selles. « Les selles contiennent un grand nombre d’organismes différents, dont certains peuvent être pathogènes, mais la plupart d’entre eux sont bénéfiques pour nous », a déclaré le Dr Patel. «Il peut aussi y avoir une présence transitoire de pathogènes ou d’organismes qui pourraient être des agents pathogènes chez une personne et non chez une autre, selon ce qui se passe avec eux.» Cette situation ne justifie pas nécessairement un traitement, dit-elle.

Pour aider les cliniciens, la Mayo Clinic a développé un algorithme de test pour les causes infectieuses de la diarrhée qui recommande le panel GI seulement pour les cas de diarrhée acquise dans la communauté qui ont persisté pendant plus d’une semaine. Pour les patients souffrant de diarrhée associée aux soins de santé, Mayo recommande aux médecins de commander un test PCR de toxine de C. difficile seul. Mayo Clinic fournit également des commentaires d’interprétation dans son rapport de laboratoire lorsque certaines cibles sont détectées par le groupe d’experts en GI. Lire l’article dans son intégralité pour plus d’informations sur les tests de panel PCR multiplex.